位于东京西部的巨大“学园都市”。在总人口达230万人，其中约8成是学生的这座都市中，实施着超能力开发的特殊课程，学生们的能力被给予从“无能力Level 0”到“超能力Level 5”的六阶段评价。
　　高中生上条当麻，也是住在学园都市的学生之一。他由于隐藏在右手中的力量——只要是异能之力，就连神的加护都能消除的“幻想杀手Imagine Breaker”，而被评价为名落孙山的“无能力”，过着充满不幸的人生。
　　而上条的学生生活，由于暑假开始时从天而降的纯白修女而发生了巨大的变化。自从与逃离“魔法”世界的她——“禁书目录茵蒂克丝”相遇开始，上条就被卷入了各种各样的事件中。统率学园都市的“科学”方、与茵蒂克丝关联的“魔法”方，在惊险地解决双方事件的过程中，他的人际关系也逐步扩展。之后，魔法一方的十字教最大宗派罗马正教，终于注意到上条的存在……。
　　如同呼应魔法方一般，科学方的学园都市也有所动作。但也有与逐渐开始对立的世界动向抗争的人不断出现。那些通过与上条有所关联，而使命运大为改变的“英雄”们。
　　他们挺身而出与世界对峙。如同上条当麻做过的那样。
　　科学与魔法第三次交织之时，故事将大幅推进！！

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游客2019-03-16
时隔八载的有生之年续作，算是入宅作品。上条当麻、小黄书、一方通行、炮姐，看的不是动画而是青春。半年番的分量也是满足。

游客2019-02-23
一个号称科学之城的地方却总靠超能力解决问题，一群反科学的魔法师却在一个连下雨都能精确到秒的地方进出自如.明明知道男主能力是消除异能却一定要用异能去对付他，这不是一枪就能解决的事么？科学之城无人信仰科学，全在想办法怪力乱神，有问题全靠学生解决，这么幼稚的东西还能出三？

游客2019-02-23
锦织博0分，第一季第二季搞成那种鬼样子，到第三季还是熟悉的卖肉，您这怎么过了几年了品味还是这样？这都2018年了，还在洗澡露内裤卖福利，第一集还让本不该出场的人物出场，为什么动画bd和超炮动画销量差那么多，锦织博还有没有点逼数了？？长颈龙监督魔禁都比锦织博强吧？锦织博和锦织敦史这两人我算怕了，等了几年就交出这种质量的作品，赶工和敷衍人也不是这样敷衍的吧？赶剧情赶的要命，干嘛，赶着去投胎吗？？我真心...

游客2019-02-23
过了这么多年，还以为能升华到什么程度呢，结果也就这样，还不如不出

游客2019-02-23
也许时隔多年魔禁3让我忘记了前两季实际上并不是很出色。我还不如去看小说，虽说能动就行，但是也要有底线！ 监督锦织博在第三集就暴露了原型，即便剧情还原再差，战斗场景再烂，逻辑再崩坏，也要强行卖福利。那点烂水平，根本驾驭不了魔禁世界观和剧情。 他就不能滚回去做他的后宫动画去，别来碰魔禁，偏偏他自己还没有自知之明。